La Oficina de Control Institucional ejecuta las acciones de control en el ámbito del sector Educación, en armonía con la Ley Orgánica del Sistema Nacional de Control y las disposiciones legales vigentes. Está a cargo de un Auditor, quien mantiene una relación funcional y administrativa con la Contraloría General de la Republica y depende jerárquicamente del Director Regional de Educación.
